Pour faciliter les échanges avec les utilisateurs et le suivi des projets dont j'ai la responsabilité sur la plateforme d'analyse d'images de l'institut Pasteur, j'ai mis en place un cadre de travail basé sur des rapports bookdown, git et GitLab Pages. Les rapports créés ont une structure commune qui (1) présente le projet, (2) décrit les méthodes d'analyses, (3) présente les résultats, mais aussi (4) recense les échanges avec les utilisateurs, ainsi que les moments clés du projet, ce qui limite la perte d'information et permet d'avancer dans un cadre serein. Comme j'utilise toujours la même structure de projet, et que certaines informations sont répétées d'un rapport à un autre, j'ai créé le package R {bookprep}, pour automatiser la création de ce cadre de travail.